На протяжении 2000 г. происходила постепенная концентрация Центра на трех основных тематических направлениях. Так, в рамках программы «Омбудсман» при поддержке Совета Европы было проведено шесть семинаров-тренингов по развитию института Уполномоченного по правам человека: в Ростове-на-Дону, Краснодаре и Махачкале, в подмосковном Звенигороде, в Смоленске и в Калининграде. Летом 2000 г. в рамках программы «Региональный омбудсман» начался проект при поддержке фонда Дж. И К. Макартуров, что позволило увеличить эффективность всей программы.
Целью программы «Прозрачный бюджет» в 2000 г. являлось развитие общественного участия в бюджетном процессе в восьми городах проекта (Санкт- Петербурге, Мурманске, Петрозаводске, Великих Луках, Пскове, Самаре, Новосибирске и Южно-Сахалинске), а также содействие в реализации подобных инициатив в других регионах путем оформления накопленного опыта в методические рекомендации и документы.
Основным содержанием антикоррупционной программы в 2000 г. была реализация проекта «Участие некоммерческих организаций и органов местного самоуправления в предотвращении коррупции» при поддержке Фонда развития демократии «National Endowment for Democracy» (США). Кроме того, в феврале 2000 г. СПб центр «Стратегия» провел итоговую конференцию и мониторинг результатов проектов программы фонда «Евразия» «Предупреждение коррупции силами гражданского общества».
2001 г.: программы Центра дают первые практические результаты
В рамках программы «Региональный омбудсман» продолжилось сотрудничество с Департаментом прав человека Совета Европы и с датской НПО «Развитие диалога» при поддержке Демократической инициативы ЕС по развитию института Уполномоченного по правам человека в регионах России. Соответствующие семинары прошли в Саратове (февраль), Красноярске и Екатеринбурге (март), Сочи (апрель), Подмосковье (ноябрь). Совместно с Департаментом прав человека Совета Европы были подготовлены и проведены два круглых стола Уполномоченных в Саратове и в Смоленске.
В 2001 г. успешно развивалась и программа «Прозрачный бюджет». Наряду с проектом, поддержанным фондом Форда, был реализован проекта «Общественное участие в бюджетном процессе на Северо-Западе России» при поддержке фонда «Евразия», а также усилилась работа в рамках широкой сети других проектов НКО, направленных на участие общественности в бюджетном процессе.
В рамках антикоррупционной программы при поддержке NED был реализован проект «Гражданское общество против коррупции на Северо-Западе России». География проекта: Санкт-Петербург, Ленинградская область, Псковская область, Республика Карелия. Вторым антикоррупционным проектом в 2001 г. стал проект «Вовлечение жителей местного сообщества в антикоррупционную деятельность (на примере г. Пушкин)». Проект был направлен на развитие общественного участия в процессах принятия решений органами муниципальной власти и укрепление прозрачности и открытости органов местного самоуправления.
В 2001 г. получило свое развитие сотрудничество СПб центра «Стратегия» С Администрацией и Законодательным Собранием СПб. Был заключен и исполнен договор на разработку нормативных актов в рамках программы реформирования бюджета Санкт-Петербурга. В 2001 г. был также заключен и исполнен договор с Комитетом по законодательству Законодательного Собрания СПб.
2002 г.: Международная конференция по предупреждению коррупции
В 2002 г. получили развитие все три традиционных уже для Центра направления деятельности, при этом каждое из них имело в этом году свое особое направление. Так, рамках программы «Омбудсман и права человека» при поддержке фонда Макартуров был реализован проект «Создание и апробация системы повышения квалификации (дополнительного образования) Уполномоченных по правам человека в субъектах РФ и сотрудников их аппаратов».
В рамках антикоррупционной программы в октябре 2002 г. в пригороде Санкт-Петербурга г. Пушкине прошла международная конференция Межрегионального диалога доверия (МДД) «Предупреждение коррупции: что может общество (Антикоррупционный мониторинг)». Финансовую поддержку в проведении конференции оказали программа «Восток-Восток» Института «Открытое общество», Институт «Открытое общество», правительство США и фонд «Евразия». В конференции приняли участие более 110 человек: лидеры НКО, вовлеченных в деятельность по противодействию коррупции в 16 странах с переходной экономикой, ученые и специалисты из России, Австралии, Франции и Германии, представители федеральных, региональных и местных властей.
В этом же году был проведен семинар, посвященный развитию Центров публичной политики и фабрик мысли, который положил начало новой программе Центра «Развитие публичной политики и Центров публичной политики».
На базе программы «Омбудсман» стало развиваться и направление, связанное с гражданским образованием. Результатом явилось создание Центра гражданского образования и прав человека СПбГУ, который начал свою деятельность весной 2002 г. при непосредственном участии СПб центра «Стратегия», а также активизация работы Общественного экспертного совета по гражданскому образованию и образованию в области прав человека при Комитете по образованию и науке Государственной Думы РФ.