Выполнением сети Петри управляют количество и распределение фишек в сети. Фишки находятся в кружках и управляют выполнением переходов сети. Сеть Петри выполняется посредством запусков переходов. Переход запускается удалением фишек из его входных позиций и образованием новых фишек, помещаемых в его выходные позиции.
Переход может запускаться только в том случае, когда он разрешен. Переход называется разрешенным, если каждая из его входных позиций имеет число фишек по крайней мере равное числу дуг из позиции в переход. Кратные фишки необходимы для кратных входных дуг. Фишки во входной позиции, которые разрешают переход, называются его разрешающими фишками. Например, если позиции p1 и p2 служат входами для перехода t4, тогда t4 разрешен, если p1 и p2 имеют хотя бы по одной фишке. Для перехода t7 с входным комплектом {p6, p6, p6} позиция p6 должна обладать по крайней мере тремя фишками, для того чтобы t7 был разрешен.
Определение 4. Переход tj Î T в маркированной сети Петри С = {Р, Т, I, O) с маркировкой m разрешен, если для всех pi Î P
.
Переход запускается удалением всех разрешающих фишек из его входных позиций и последующим помещением в каждую из его выходных позиций по одной фишке для каждой дуги. Кратные фишки создаются для кратных выходных дуг. Переход t3 с O(t3)={p7, p13} и I(t3)={p2} разрешен всякий раз, когда в p2 будет хотя бы одна фишка. Переход t3 запускается удалением одной фишки из позиции p2 и помещением по одной фишки в позиции p7 и в p13 (его выходы). Дополнительные фишки в позиции p2 не влияют на запуск t3 (хотя они могут разрешать дополнительные запуски t3).
Запуск перехода в целом заменяет маркировку m сети Петри на новую маркировку . Заметим также, что так как можно запустить только разрешенный переход, то при запуске перехода количество фишек в каждой позиции всегда остается неотрицательным. Запуск перехода никогда не удалит фишку, отсутствующую во входной позиции. Если какая-либо входная позиция перехода не обладает достаточным количеством фишек, то переход не разрешен и не может быть запущен.
Определение 5. Переход tj маркированной сети Петри с маркировкой m может быть запущен всякий раз, когда он разрешен. В результате запуска разрешенного перехода tj образуется новая маркировка , определяемая следующим соотношением: .