После освобождения Москвы правительство Пожарского и Трубецкого «Совет всея земли» разослало по городам приглашение прислать в Москву по 10 человек от города для царева избрания. К январю 1613г. в Москву съехались представители от 50 городов, которые и составили Земский собор. Претендентами на престол были: польский королевич Владислав, сын шведского короля Карл-Филипп, Иван – малолетний сын Марины Мнишек и Лжедмитрия II (в народе его называли «воренком»), и представители знатных московских боярских фамилий. Отвергли Владислава, отвергли и шведского королевича Филиппа, который был избран под напором шведских войск на новгородское царство. В конце концов, решили не рассматривать больше иноземные кандидатуры. Когда перешли к обсуждению русских кандидатур, начались споры: Черкасский, Пронский, Трубецкой, Пожарский. Казаки предложили избрать Федора Романова. Напомнили легенду о том, что умирающий Федор Иванович завещал престол именно ему, но тот отказался и на престол взошел Борис Годунов. В конце концов, стало ясно, что наиболее подходящей кандидатурой является молодой Михаил Федорович Романов (сын Федора Романова (митрополита Филарета)). 7 февраля 1613г. Земский собор остановил свой выбор на 16 летнем Михаиле Романове. Но с окончательным избранием не спешили. Выждав 2 недели, в города послали гонцов узнать, люб ли новый царь народу? 21 февраля 1613г. Михаил Романов был провозглашен царем и ему присягнули члены Земского собора и Москва. Романов был очень подходящей кандидатурой. Он устраивал всех по многим причинам. Во-первых, на него, как на возможную кандидатуру на престол, неоднократно указывал патриарх Гермоген. Во-вторых, Михаил был ближайшим родственником Ивана Грозного по линии его жены (царица Анастасия была Романова). В-третьих, он в силу своего возраста не участвовал в событиях смуты, и таким образом не был запятнан. В-четвертых, его отец митрополит Ростовский Филарет, хотя и находился в плену, был при Годунове очень влиятельным при дворе человеком, и так же первым и единственным кандидатом на патриарший престол. В-пятых, молодость Михаила воспринималась как благо – им легко будет руководить. У Михаила был мягкий нрав. И это тоже было благо, т.к. страна устала от жестоких правителей и ждала спокойного правления. Романовы устраивали всех Дед Романова, Юрьев был близок к Грозному, но пользовался репутацией защитника невинно пострадавших. Родственники Романовых были и среди опричников, и среди казненных. Таким образом, избрание Михаила Романова сулило спокойствие и всеобщее согласие. Но главный повод избрания – формальное родство с прежней династией Рюриковичей.
Но нового царя не было в Москве. Он находился с матерью – инокиней Марфой в Ипатьевском монастыре под Костромой. Марфа опасалась за судьбу сына и долгое время не давала добро на его избрание. Под Костромой находились родовые имения Романовых. Предание рассказывает, что поляки решили извести Романова, чтобы очистить престол для своего королевича. Пробираясь через леса и болта, они попросили крестьянина села Домнино Ивана Сусанина показать дорогу. Согласно официальной версии он отказался и был замучен. А по народной легенде, Сусанин согласился, но послал к царю гонца с предупреждением, а сам завел поляков в непроходимые болота. Осознав обман, поляки убили Сусанина, но и сами погибли от голода и стужи. «Жизнь за царя». Вступая на престол, Михаил Романов не дал подданным никакого договора. Царская власть вновь становилась самодержавной, как при Рюриковичах.
14 марта 1613 года Михаил принял царство и поехал в Москву. Святитель Московский патриарх Гермоген не дожил до светлого дня освобождения Москвы. Брошенный на произвол судьбы в глухом подвале Чудова монастыря, он мученически скончался 17 февраля 1612 года. Позже он будет причислен Русской Церковью к лику святых и станет одним из покровителей Москвы, а место его заточения и смерти превращено в храм, стертый с лица земли вместе с Чудовым монастырем в 30 годы прошлого столетия. Но гробницу святителя мы можем видеть в Успенском соборе.