Біологічні заходи ґрунтуються на використанні різних живих організмів або продуктів їх життєдіяльності для знищення або зниження чисельності окремих видів бур’янів. Ними можуть бути бактерії, віруси, гриби, комахи, кліщі, нематоди тощо. Найчастіше в практичному землеробстві використовують комах і гриби, для яких бур’яни є джерелом поживи. Це стосується і заглушення бур'янів культурними рослинами.Метод цей екологічно чистий, перспективний і його можна використовувати там, де інші методи боротьби з бур'янами непридатні (на луках, пасовищах, посівах овочевих культур тощо).Залежно від специфічності і спрямованості біологічну боротьбу з бур'янами можна розглядати в таких аспектах:1. Використання комах, нематод та інших організмів, які живляться рослинами-бур'янами. Характерною особливістю їх є вузька спеціалізація до окремих рослин. Використання цих організмів має значення для боротьби з дуже злісними бур'янами, які важко знищуються агротехнічними чи хімічними способами (амброзія полинолиста, вовчок, гірчак повзучий, осот польовий, повитиця тощо).2. Використання фітопатогенних мікроорганізмів та вірусів, які спричинюють захворювання окремих бур’янів. Це, насамперед, гриби. Так, гриб пукцинія уражує осот рожевий, гірчакова іржа — гірчак степовий повзучий — один з найшкідливіших багаторічних бур’янів Степу. Гриб фузаріум вовчковий, внесений у ґрунт при сівбі тютюну і махорки, уражує вовчок ще в стадії проростків. Досить ефективно діє цей гриб на посівах баштанних культур. У боротьбі з повитицями застосовують гриб альтернарія. У природних фітоценозах часто спостерігається ураження листя пирію і стоколосу — іржею, суцвіття вівсюга, мишію — сажкою. Більшість видів гриба — вузько специфічні і безпечні для культурних рослин.3. Використання біогенних препаратів— продуктів біосинтезу мікроорганізмів, які токсично діють на окремі бур'яни.Можливості біологічного методу поки що обмежені. Це пов'язано з тим, що не завжди вдається підібрати такі види організмів, які, стримуючи ріст і розвиток бур'янів, не шкодили б культурним рослинам. До недоліків методу належить і дуже вузький спектр дії цих організмів (у посівах, як правило, росте не один вид бур'янів), труднощі в доборі монофагів, практична неможливість керувати діяльністю біологічних заходів, уразливість бур'янів.4. Використання для боротьби з небажаною водяною рослинністю деяких видів риб і птиці. Так, у боротьбі з дуже шкідливими бур’янами (бульбокомиш морський, очерет, рогіз) у водному середовищі використовують таких риб як амур білий та товстолобик, яких розводять у магістральних каналах, а іноді і рисових чеках. Зернівки проса рисового в чеках протягом осінньо-зимового періоду поїдають качки-крякви.
Фітоценотичні заходи
Використання в сівозміні культур, здатних пригнічувати бур'яни. За здатністю пригнічувати бур'яни культури умовно поділяють на такі групи:1) висококонкурентоздатні — озиме жито, озима пшениця, озимий ячмінь, озимий ріпак, коноплі, злаково-бобові сумішки на зелений корм;2) середньоконкурентоздатні — горох, люпин, гречка, овес, ячмінь, яра пшениця, тютюн, кормова капуста, соняшник;3) слабоконкурентоздатні — кукурудза, картопля, просо, сорго, цукрові буряки, льон, овочеві культури.
Комплексні заходи
Доведено, що кожен із наведених вище заходів не може дати ефективного очищення грунту від насіння та рештків рослин Тому ці заходи поєднують і вони дістали назву , як комплексні.Головними складовими комплексних заходів боротьби з бур’янами залишаються обробіток ґрунту та сівозміни, тобто механічне та фітоценотичне знищення бур’янів.У комплексі з ними застосовуються і всі інші заходи.Поєднання хімічних і механічних заходів.Комплексне застосування цих методів посилює дію кожного зних і дає можливість ефективно боротися з багатьма бур'янами. Хімічні методи боротьби збур'янами не тільки посилюють механічні, а й зменшують негативний вплив останніх на водний режим грунту і його структуру. Якщо частину обробітків грунту в чистому пару, спрямованих на боротьбу з бур'янами, замінити хімічним прополюванням, то це запобігатиме надмірним втратам вологи і зменшуватиме розпилювання грунту, що має велике значення у районах поширення вітрової ерозії.У практиці часто поєднують механічніібіологічні заходи. За такого поєднання бур’яни активно знищуються або дуже послаблюються механічними заходами боротьби (оранкою, глибоким безполицевим розпушуванням чи поверхневим обробітком ґрунту), а створені таким чином належні умови для росту і розвитку дають змогу культурним рослинам успішно конкурувати з бур’янами, заглушуючи їх добре розвиненою надземною частиною.Поєднання хімічних, механічних і біологічних методівдає можливість боротися з бур'янами протягом вегетаційного періоду, що й визначає його високу ефективність.Отже, запровадження інтегрованої системи боротьби з бур'янами, заснованої на раціональному використанні відомих методів захисту посівів,— реальний захід зменшення засміченості і підвищення культури землеробства.